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北京农学院生物信息中心超融合计算平台开放服务与管理办法

作者:    信息来源:    发布时间: 2022-03-22

北京农学院生物信息中心

超融合计算平台开放服务与管理办法


生物信息中心 v202204

北京农学院生物信息中心超融合计算平台是校级公共服务平台,在学校林木分子设计育种高精尖创新中心,都市农业特色平台建设项目经费支持下建立,由生物信息中心和图书馆进行管理与运行。为了充分发挥超融合计算平台的科研服务和计算能力,引导用户合理、科学地使用计算资源,特制定平台计算资源开放服务与管理办法。


一、服务范围

1、生物信息中心超融合计算平台向北京农学院所有具有生物信息高通量测序数据分析需求的研究团队、教师、研究生,及教学团队提供服务。在资源允许的情况下,对非生命科学研究人员提供有限计算服务。

2、优先保证对高性能计算需求强烈的用户使用,特别是冲击国际前沿水平、涉及国家重点科研项目研究、涉及重大基础理论研究的相关课题。

二、计算资源类型及申请方式

生物信息中心超融合计算平台计算资源类型有学习账号、科研账号、计算实例、托管用户四种计算资源可以申请。

1. 学习账号

为了方便广大师生使用超融合计算平台服务器学习生物信息基础知识,特设立学习账号。学习账号具有以下特性:

a) 账号免费使用,有效期为最长为12个月(从开通时间到每年1231日)。

b) 账号开通后,请修改默认密码为复杂密码;账号开通一周后,如密码仍为默认密码,或者为简单密码,系统管理员将停止账号使用。

c) 账号到期后将自动锁定,如需继续使用,请在账号到期(1231日)之前再次提交申请。

d) 账号锁定后,数据将会被删除;如有重要数据,请及时备份。

e) 开通账号请将以下信息发邮件到bioinfo@moilab.net,邮件标题为:学习账号申请。

账号ID(英文字母或数字组合,例如yz357

项目名称:(例如:黄瓜非编码RNA调控网络分析)

课题/项目组名称:(例如:郑轶课题组)

申请人姓名:

申请人学号/工号:

申请人身份:(研究生/老师/博士后):

申请人紧急联系电话:

2. 科研账号

科研账号是为了满足广大师生利用超融合计算平台服务器对生物组学大数据进行分析。相比学习账号,科研账号服务器具有更强大的计算能力,更多的CPU计算线程,内存容量,及存储资源。适用于转录组、表观组、微生物组学,及一般生物信息项目的分析。

a) 账号免费使用,并可以自行设定账号使用时长,有效期为最长为36个月。

b) 如账号实际使用者为在读研究生,有效期为研究生毕业当年的1231日。

c) 账号开通后,请修改默认密码为复杂密码;账号开通一周后,如密码仍为默认密码,或者为简单密码,系统管理员将锁定账号。

d) 账号到期后将根据申请人的实际情况,对账号进行延期、扩容、锁定、删除等操作

e) 开通科研账号流程:

i. 在生物信息学中心网站下载打印《北京农学院生物信息中心计算资源申请表》

ii. 如实填写相关信息,课题负责人签字后将纸质文件交到生物信息中心办公室(科技综合楼D301室);

iii. 接到申请表的一个工作日内,以邮件方式通知申请人审批结果。


3. 计算实例

计算实例是北京农学院生物信息中心超融合计算平台特有计算资源类型。与科研账户相比,计算实例独享服务器的计算资源,具有更加灵活的配置、更快的计算速度、更大的存储空间。同时,还具备以下优势:

a) 具有管理员权限,无需通过生物信息中心,可以为项目组成员建立账户,适合具有一定规模的项目组或团队;

b) 以管理员身份安装生物信息软件,不受限制;

c) 自行负责服务器的安全措施。

计算实例申请人要具有一定的服务器维护能力,申请计算实例请联系生物信息中心进行面谈,联系方式:bioinfo@moilab.net

4. 托管用户

中心还将为拥有计算资源的课题组提供服务器托管服务,请联系生物信息中心进行面谈。联系方式:bioinfo@moilab.net

5. 其它

当急需计算资源或较大存储空间,请联系生物信息中心进行面谈,中心将根据具体情况鼎力支持。


三、使用规则

用户申请以上计算资源可获得生物信息中心相关技术支持。同时,必须严格遵守相关的管理制度。

1、用户应根据实际需要使用计算资源,并严格遵守操作规范,通过运维安全审计系统登陆节点提交作业和获得结果。严禁直接登陆到计算节点上运行程序,严禁在非计算节点执行任何计算任务。

2、本平台仅用于高性能计算,不可专门用于数据存储。请在数据分析完成后,及时对原始数据和分析结果进行备份,以免造成不必要的损失。

3、禁止对外提供网络服务,占用网络带宽,包括但不限于http网页服务,ftp下载服务等。禁止利用高性能计算平台泄露国家机密或从事违法犯罪活动。

4、用户应对自己的作业和数据的安全负责,定期备份或整理数据,防止发生数据损坏、丢失和泄密问题。尤其是涉及知识产权的计算结果,应及时取回、清理。

5、用户不得有偿或无偿转让所申请的计算资源,也不得借用他人使用计算资源,一经发现,本中心将随时停止计算资源的使用。

6、对于利用超融合平台得到的成果,用户在发表科研论文、技术报告或其他形式的成果时,应以适当的方式表明该成果得到北京农学院生物信息中心的支持,从而体现超融合计算平台的贡献,促进平台可持续发展。生物信息中心根据引用与致谢对用户进行相关奖励。引用范例:

本课题/项目/研究得到北京农学院生物信息中心的支持。或在Acknowledgements中指出: supported by the Bioinformatics Center, Beijing University of Agriculture

7、生物信息中心有权引用用户成果报告中与高性能计算相关的报告内容。生物信息中心有权定期根据申请人的资源使用情况和研究成果进行资源调整。

8、用户应及时将使用中存在的问题和建议反馈给生物信息中心。

9、对违反制度者,中心可根据情节轻重责令其限期改正、给予警告、停止向其提供计算服务,并向所在单位通报。如有严重违规或违法者,将根据国家相应的法律规定进行追究。


四、计算资源年度使用报告:

1为了更高效的利用超融合计算平台的资源,申请科研账号、计算实例、及托管用户需每年对计算资源使用情况进行年度总结并形成报告,即年度使用报告。报告内容包括计算资源所服务的科研项目、科研成果、使用中的问题及建议等。中心将基于该报告更加高效地分配与调整计算资源,服务于科研与教学项目。

2. 报告填写内容详见“北京农学院生物信息中心计算资源年度使用报告模板”。除学习账号外,申请科研账号、计算实例、及托管用户于每年1220日前根据模板填写计算资源年度使用报告,并用A4黑白打印(单双面均可),由项目负责人签字后提交生物信息中心办公室。

3. 未按时提交计算资源年度使用报告,将视为放弃本年度所申请的计算资源的使用,所申请的计算资源将于当年的1231日自动释放。出于安全和使用效率,当计算资源释放后,该账号下所有数据及程序将自动销毁。

4. 未按时提交当年计算资源年度使用报告,将会影响下一年度计算资源的申请。



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