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2020年秋季生物信息编程马拉松(hackathon)第一期

作者: 生物信息中心   信息来源:    发布时间: 2020-08-30

时间:2020年9月5日(周六)9:30 - 15:00

地点:根据参加人数待定

报名:请发邮件到 bioinfo@moilab.net 报名,报名截止日期2020年9月4日(周五)下午16:00。请在邮件中简要介绍自己目前掌握的生物信息分析方法,主要使用的编程语言,以及从下列主题中选择感兴趣参与的主题。报名成功后会收到确认邮件,以及具体的日程安排。

报名邮件示例:

邮件标题:编程马拉松报名

姓名:张三

学院:植科学院

本人有5年Linux使用经验,熟悉生物信息转录组可变剪切的分析流程,目前主要使用编程语言为Perl,也会一些简单的Shell脚本。

参与主题:1,2

注意:编程马拉松面向有一定计算机基础的老师和学生,需要熟练使用Linux操作系统及Shell脚本,掌握Perl,Python,或R其中任何一门编程语言;需要学习生物信息分析的老师可以参加生物信息中心举办的Workshop

参加编程马拉松请自备能上网的笔记本


主题

1. 代码管理工具Git的使用,Markdown文档编写

2. 转录组(RNASeq)质量控制及分析流程开发

3. 组学数据库配置及开发(组学数据库开发需要提前掌握Flask框架和mongodb



 

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